En Darktable, para tener distintas mascaras con distintos ajustes debes crear una instancia nueva o tantas como ajustes distintos precises.
En la misma instancia, las máscaras que crees, tendrán los mismos ajustes.
Aquí tienes tres instancias en exposición:
Cada una de ellas es independiente de la otra.
Puedes verlo si clicas en el icono de la derecha
Mascara Exposición 2
Mascara Exposición 1
Saludos.